在日向宗家的邀请，小影接受了他的邀请是殊不知宗家邀请自己的客人前先要进行一场对决，最终小影利用日向一族的忍术让日向宗家震撼到他自己，在宴会小影一直在思考日向家族的事情，之后宴会结束，在火影办公室中从自己的舅舅口中得知日向一族是羽村的后裔
另一方面，弥彦一行人悄悄来到木叶村村外找小影，让小影秘密加入到组织当中，在双方的商量下，小影同意加入到组织当中并秘密作为组织成为的隐藏人员在那之后，小影去木叶训练场找奥斯曼一行人，来到众人面前时，就见到了宇智波族中的天才少年－－止水，随后，二人展开一场对战看看双方的实力究竟如何，最终小影利用飞雷神结合忍具赢了这场对战
所有的事情在小影和水门的计划中一直进行着，大蛇丸在小影那里见到了自己的未来之后，偷偷的逃离木叶村去寻找自己想要的东西；带土利用宇智波斑的身份一直和黑影观察着各个村子中所有的事情
时间来到阿斯玛一行人都成功的在木叶学校中毕业，成为上忍，在这期间各自学习了很多，都和小影完成了许多的任务；而止水在富岳族长推举下进入到了暗部中一直留在小影的身边；卡卡西一直帮助水门的工作并在暗部中结识了一位后辈－－大和，二人发生了一些事情最终在卡卡西的劝说下，大和一直在小影的身边；另一方面，弥彦一行人在雨之国和其他村子中帮助村民不少的事情，在这期间招揽许多的忍者进入到他们之中，最终以组织的名义传遍各个角落
夕日红：我说小影 这都几年了，你的样子和身高为什么一直和以前一样没有变啊
小影：当年，我跟你们说过 都是我在水晶中产生的后遗症 猿飞叔叔也是头疼一直想尽办法也没有治疗好
阿斯玛：不过话说回来 自从止水成为暗部一直在小影的身边，小影也比以前精神多了
小影：阿斯玛哥哥，不可别笑话我了 对了止水哥哥，鼬哥哥（在这里，小影把将宇智波鼬看作自己的‘小哥’）呢
止水：哦！鼬一直在照顾他刚刚出生的弟弟
小影：我忘了 美琴婶婶又生下宝宝了 名字想好了吗
止水：听说富岳族长起名他的第二个孩子叫做佐助
小影：佐助！？ 那不是猿飞叔叔的
阿斯玛：我也问过父亲了 父亲说不建议的
小影：是不是富岳叔叔希望这个孩子像猿飞前辈一样将来成为一名强悍而又伟大的忍者啊
止水：应该是 不过最主要的是你
小影：我！？ 为什么啊
阿斯玛：父亲说了，宇智波一族有今天的景象全是因为你改变了当年对宇智波族所做的一切
小影：这样啊 对了，你们先聊着我去一趟村外，我马上回来
凯：哎！！ 你们说小影也真是的，弥彦他们的事情我们都已经知道了 她干嘛要还有自己一个去跟弥彦他们见面啊
阿斯玛：自从那天的事情后，小影已经不想被别人知道任何事情了
凯：也是，那件事之后 现在全村上下有谁不知道小影是特级火影的事情了
卡卡西：喂！凯 当年的事情还不是因为情况特殊，小影才会对村民们亲口承认自己的特级火影事情的 再说了，从那件事情后 村民们也明白了小影的用意和苦衷不是吗
当年小影的特级火影身份，意外的让带土和黑影所造成的当时，小影和自己的舅舅在火影办公室商量将来的一些计划，没想到全村上下都收到一张奇怪的信纸，可村民们毫不犹豫的打开纸，在那之后，村民们感染了具有非常特殊的病毒再加上病毒里面含有细微的黑暗能量慢慢进入到村民们的体内，发病之后，大肆想要获取别人身上的查克拉，为了保护这些村民们，小影顾不了特级火影的身份安排所有的事情最终在小影以自己的鲜血结合冰玉莲花净化村民们体内中的所有病毒和黑暗能量处理完这件事后，那个黑绝偷偷趁机借助村民们的身体将小影是特级火影身份告诉了所有的村民们
在那之后，村民们去找三代火影和水门以及富岳族长讨个说法，村民们怨恨当年火影大人欺骗大家，可是后来，当村民们见到满身血淋淋的小影和自己手中的那朵莲花时，村民们都惊呆了后来三代火影告诉所有的村民们事情的真相包括小影现在对村民们所做的事情全都对村民们说明了，最终村民们都低下头沉默了许久；之后，在能量水晶的作用下让小影恢复了过来，慢慢走到村民们面前深情对所有人深深的鞠下躬，村民们默默的看着对方的神情一句话也没有说什么，最后村民们都纷纷离开了火影办公室隔天，村民们都来到水门家中告诉小影和水门以及玖辛奈他们，各自都沉思了一夜，在一夜之中村民们想了想小影以前对他们自己的样子以及心情，村民们最终知道小影这样的目的是想弥补当年的恩情来守护木叶村所有人，最后，村民们很愿意让小影继续担任特级火影的身份后来村民们像往常一样过着平凡的生活
从那天之后，村民们每次见到小影时都会很乐意的上前来打招呼；也在那个时候，小影悄悄的在暗中与带土和黑绝见面，带土也在那个时候得知宇智波斑和小影自己的之间的事情；最终，带土秘密让小影在木叶村中作为自己的眼线获取情报，小影也会提供重要的事情来秘密帮助带土来完成月之眼计划
从那时起，带土和黑绝一切关注着弥彦一行人的行动和收集其他村子中的情报
回到现在，小影独自一人去跟弥彦一行人见面
小影：小南姐姐 长门哥哥 怎么只有你们两个啊 弥彦哥哥呢
小南：自从组织慢慢起来时，我们都忙的不可开交 我们趁着这个机会，商量接下来的事情
长门：小影 接下来的事情就是有关弥彦了 之后就是水门舅舅了
小影：这个我们知道
小南：希望你和舅舅之间的计划能够顺利成功 我们也可以回到天空之城了
小影：这个我知道 我先回去了，舅舅一直喊我回去
长门：记住，你们一定要小心行事
小影：知道了，我们会的
跟小影告别之后，长门和小南也从另一方向离开，这是三人在心里带着悲伤和痛苦的离别；此时的小影来到火影办公室中
小影：舅舅 舅妈
水门：好了 我们都知道了 接下来就是看看带土他和那个黑绝能不能完成了
小影：嗯！！ 大蛇丸那边呢
水门：他已经创造好一个小国了 全是拥有咒印的忍者，一直秘密训练他们呢 至于纲手和自来也两位前辈
小影：自从猿飞叔叔宣布大蛇丸的事情后，自来也变得越来越奇怪了 纲手也是，虽然在医疗部中有自己的弟子 但慢慢开始很爱在外赌钱了，真不知道他们两个接下来该怎么办了
玖辛奈：没办法 谁劝都不管用猿飞大人说了，让他们这样也好不做出其他的事情也是极好的
水门：小影 组织慢慢由带土控制之后，阿修罗和柱间大人的查克拉转世之魂就交给玖辛奈了 还有九尾
小影：九尾，我会亲自交给带土哥哥手上的 在那之后，舅舅你们
水门：一切都交给你、猿飞大人和卡卡西你们了 知道吗
小影：知道了
玖辛奈：到时候我们一直会在天空之城看着你们的
小影流下了痛苦而又不舍得眼泪，抱向水门和玖辛奈；呜呜！！ 舅舅舅妈
水门：好了好了 这也是唯一得办法，只有这样你才能够完成在忍界任务 也只有这样黑暗能量进入不到我们身上
玖辛奈：好了，小影 以后就要靠你，长门和小南来继续完成接下来的计划了 知道吗
小影：知道
与此同时，团藏正与雨之国的半藏秘密商议关于弥彦一行人的事情
团藏：时间过去这么久了 拥有轮回眼的那个人你还是想放过他吗
半藏：他们对雨之国所做的事情大家人尽皆知 自从你与他碰见之后，你一心想让他死 几次下来都是小影的分身一直暗中保护着 难道你不怕小影跟你闹翻吗 现在人人都知道她的身份是木叶村的特级火影 各个村子中的影级大人，听说了此事之后都跟小影达成共识，只要木叶村有难他们都会及时赶来，并且还让他们村子到木叶村中进行学习忍术
团藏：我知道，你之所以下不了手，是因为小影对你们有恩 你只是不让和他产生隔阂
半藏：嗯！ 团藏，这些年你所做的事情 小影基本都知道 我劝你不要冒这个险去做这种事情
团藏：那我只好，这样做了 幻术，写轮眼！！
半藏：什么！！
团藏利用自己抢夺的写轮眼控制了半藏，并吩咐自己的手下以偷取机密为由来追击弥彦一行人
弥彦：小影果然猜的没错，这个团藏随便找个借口来陷害我们
小南：那我们现在应该怎么办
弥彦：现在到处都是团藏的人 看看我们能不能逃到火之国中的边境或许还有其他的办法
小南和长门知道，这里跟小影对他们二人说过，弥彦就在那个地方死去
长门：只好这样了 各位，我们走！！
乌云密布，天空开始下去蒙蒙细雨，团藏和被控制的半藏带着自己的手下一路追击弥彦一行人；而小影也感应到即将面临痛苦
团藏：你们都逃不了 四周都是我旗下的忍者
弥彦：团藏，你还要执迷不悟到什么时候 几次陷害我们不够，你就是想抢夺长门身上的轮回眼 对吧
团藏：是有怎么样 难道就凭你们能守护的了他吗
弥彦：不试试怎么就不知道
团藏：可恶 都给我上，把长门给我带回来
一声令下，团藏的手下与弥彦一行人开始在雨中对打为了守护长门，他们一步也不想离开长门的身边这时，被控制的半藏利用自己的通灵兽向弥彦一行人喷射毒气，好在小影事先交给他们了月灵手环来保护自己
团藏见到小南拿出手环，在心里非常的震惊道：什么那个是小影手上的手环，这到底是为什么，为什么小影一直要守护这些人
团藏：不管这多了风遁，影分身真空手里剑！
小南：引爆式纸手里剑！ 团藏，你休想偷袭我们
团藏：什么！！ 哼！！
小南：糟了
团藏：你们都给我住手
弥彦、长门：小南！！
弥彦：你快放了小南
团藏：休想！ 想让我放了她，就必须用长门那双眼睛作为交换
弥彦，长门：什么！！
小南：长门，弥彦你们不能答应他 即使交给他，他也会杀了你们的
团藏：哈哈哈，说的没错 那么现在，你们该怎么办了
就在这时，被控制的半藏手里拿出一把带有引爆纸的苦无刃正要扔向长门时，小南大喊道：长门，小心
弥彦：长门！！
弥彦的呼喊守护住了长门的安全，但弥彦却被半藏扔过来的引爆苦无刃造成中的伤害，命悬一线
小南：啊！！ 弥彦！！
见到弥彦为了挡在自己的面前的长门，体内的能量产生变化：可恶，饶不了你们 通灵之术，外道魔像！！ 啊！！
长门召唤出来的通灵兽意外让在暗中的带土和绝见到了
带土：那个是
绝：那就是斑的轮回眼 怎么样
带土：之前与他们商量的事情 我会再去跟他们说明一切 现在他们和我一样开始对这个世界很厌恶了
随后，带土和黑绝离开了现场去做下一个准备；回过神来，长门利用外道魔像将团藏和一些雨之国的忍者完全吸收了他们所有人的查克拉
团藏手下的忍者：首领 他好像发疯了
团藏：先不管这么多了 趁这个机会，我们走
团藏带着大部分自己的忍者离开现场，小影随之慢慢的赶到了现场
小影：小南姐姐
小南：小影接下来，拜托了
小影：我知道了 冰玉莲花！嘿咦！！
小影利用冰玉莲花让失控的长门停止了暴走，而被控制的半藏也慢慢恢复了过来
半藏：小影！？ 我！
小影：你和你的忍者先回到村子里 我只能带着他们想离开着 回去之后，你的手下会慢慢告诉所有发生的事情的 小南姐姐，我们走 月灵凤凰！！
之后，小影带着只剩一口气的弥彦和昏迷的长门以及小南去往那间房屋
小南：弥彦！！
弥彦：小南 长门怎么样了
小南：已经昏睡过去了 他一会儿就会醒过来的
小影：弥彦哥哥
弥彦：小影你也赶过来了 我
小影：先别说了 我看看能不能利用莲花让你恢复
弥彦：来不及了
说话间，长门慢慢的苏醒了过来：弥彦！
弥彦：长门 接下来就靠你来守护小南和小影了 我很庆幸能够和你们去做一些帮助其他人的事情 我们永远都是最好的搭档！！
小影弥彦哥哥！！
小南，长门：弥彦！！
三人难过了许久，小影利用自己的能量将弥彦的魂之灵传送到天空之城中：能量水晶－－生命能量，召唤魂之灵，传送！！
小南：那个是
长门：小影！！ 这个是
小影：呼！！ 好了，弥彦哥哥的灵魂已经传送到了天空之城了 我们继续接着计划一＝一步一步的进行下去吧
小南：嗯，长门 带土还会找我们来借助组织的力量来进行行动
长门：一切都按照计划执行吧 至于半藏 小影他怎么办啊
小影：我想现在他已经知道所有发生的事情 他会找到我说明一些情况的 小南姐姐你们，把弥彦哥哥尸体安置在其他的地方将来长门哥哥会有帮助
小南：我知道了
小影：那长门哥哥 小南姐姐，剩下的就交给你们了 我们到时候在新的组织中再见吧
小南：嗯！ 好好照顾自己
小影：我知道了
随后，小影离开二人的面前去寻找半藏；小南和长门根据小影的计划慢慢开始下一步的行动
雨之国忍者：首领，小影来了
半藏：让她进来吧
雨之国忍者：是！
半藏：从团藏一直秘密来到这里时，他做这样的事不是一天两天了 小影，他们两个人现在怎么样了
小影：情绪慢慢稳定下来了 不过
半藏：不过什么
小影：不过，他们总有一天会过来找你 你到时候怎么办
半藏：我早就已经做好被他们杀的准备了 在那之前，我会给他们一个交代
小影：呼！！ 这是我跟你最后一次见面了
半藏：小影 我很感谢，你为雨之国做的一切 可是，雨之国却由我毁了他
小影：一切的命运都是有他的定数 半藏，我们再见！！
告别半藏，小影回到木叶村；小南和长门将弥彦的尸体安放了很安详的地方，之后静静等待带土和黑绝的到来
夕日红：小影，你突然离开村子把我们都吓了一跳
小影：抱歉抱歉我去做一件做非常紧急的事情了 所以没有打招呼就离开了
阿斯玛：算了算了 回来就好了
小影：对了 止水哥哥呢
阿斯玛：他去帮助鼬做苦无刃的训练去了
小影：那我去看看他们
阿斯玛：等等小影，我们也要跟你一起去免得你再突然跑到其他的地方
小影：好！
团藏借助半藏来加害弥彦一行人，最终导致弥彦死在半藏的引爆苦无刃之中，使得长门暴走利用轮回眼的力量召唤外道魔像，这也让暗中的带土和绝很是开心；失去同伴的长门和小南，二人按着自己的妹妹小影所暗中策划的计划整备下一个计划，等待带土和绝进行秘密策划将来的行动