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鲁迅在教育部教材司主事的位置上，以人性和人类文明的角度，重新编修了中国历史的教科书，越是苦难的历史，越记载得详细，对一些历史人物和历史事件重新评价，引起社会巨大的争议，比如秦始皇焚书坑儒，坑杀几十万降卒，被列为千古暴君，汉武帝的罢黜百家，独尊儒术，被认为是中华民族思想史上最黑暗的一天，过去所谓的康乾盛世，也被鲁迅挖出很多文字狱来，并且对清朝取代明朝，鲁迅认为这是历史的倒退，满清野蛮封闭的制度，思想上的禁锢，造成了中国近代的落后。太平天国的运动，被认为是洪秀全等农民装神弄鬼的造反。
报纸上很多保守的人受不了，连篇累牍攻击鲁迅数典忘祖。鲁迅则以“中国一些遗老遗少，总爱无中生有，移花接木造出一些故事来，他们不但歌颂生平，还粉饰黑暗”，“有缺点的战士终究是战士，宝贵的苍蝇始终是苍蝇”等在报纸上公开回应。
教育部总长严复拿着鲁迅主编的历史教科书去找宋骁飞，宋骁飞看了之后，表示赞赏。在1907年春，还任命鲁迅为教育部副部长，让他到各大学去“煽风点火”，要给中华民族来一场文化的大革命。
鲁迅履新职后，去的第一站，就是国立北京大学，校址在北京市景山东街，也就是现在景山公园附近。北京大学是北方的最高学府。中华共和国最早成立的四所国立综合性大学之一，其他分别是中部的国立武汉大学，上海的国立上海大学。南方的国立广州大学。这四所大学是中国思想的发源地。
那天是北京大学崇实学院的开办仪式，仪式隆重之至。大总统宋骁飞不仅亲自为崇实学院题写了院名，还率内阁总理盛宣怀，教育总长严复，司法总长梁启超一并出席，规格礼遇之高，着实罕见。连《纽约时报》驻中国的记者莫理循。嗅到一丝不同寻常的味道，也通过美国公使向外交部门提出申请，希望这天能参加。宋骁飞表示同意。并且让外交部发出公告，表示凡是愿意参加的西方记者，都欢迎参加。而且这次活动，报纸上还发出公告。征集三十读者参加。
举行完隆重热烈的相关仪式后。鲁迅并没有立即离去，将所有的学子们都召集到礼堂里面，作有关教育改革的重要形势报告。礼堂里面黑压压的沾满了将近两千名学子，各部官员和北京高校的教习们站在两侧。
站在人群中的鲁迅微微弯下腰去，鞠躬行礼，目光却带着些许的激动，缓缓走到人群前面。鲁迅的八字胡翘起，也许是太累的缘故。他面容看起来消瘦和苍白，嘴角带着一丝浅浅的但却是无比自信的笑容走到人群前面。平静的注视着下面的人群。
鲁迅的演讲，先对政府的政策表示赞许，说：“近十年来，大总统颁布了一系列法令，设立农工商局、路矿总局，提倡开办实业；修筑铁路，开采矿藏；组织商会；改革财政，在政治上，广开言路，开放报禁；;设译书局，派留学生；奖励科学著作和发明，科技强军。这些革新政令，目的在于学习科学技术和经营管理制度，使国家富强。效果也很好。但是，我们的思想还不够解放。
看见底下议论纷纷，鲁迅停顿了一会，大声说：“连满清的光绪皇帝，在《定国是书》都知道说：数年以来，中外臣工讲求时务，多主变法自强……惟是风气尚未大开，论说莫衷一是，或托于老成忧国，以为旧章必应墨守，新法必当摈除，众喙哓哓，空言无补……嗣后中外大小诸臣，自王公以及士庶，各宜努力向上，发愤为雄，以圣贤义理之学，植其根本，又须博采西学之切于时务者，实力讲求，以救空疏迂谬之弊。”
说到这，鲁迅清了清嗓子，提高了声调：“其实这世间的学问，不分东西，是就是，不是就不是。譬如逻辑，难道还分西方逻辑和东方逻辑两种吗？这种逻辑，本身就是很可笑的。”
众人迟疑了片刻，知道鲁迅又要放炮了，议论纷纷。有些人说话的声音还有点大：“我从识字开始，就在研究中国传统文化的治国之道。世间的道或许有所不同，但是我一直在想，对于中国这样一个人口众多，地域宽阔的国家，什么才是真正的大道，什么才是让国家振兴之道!我把目光投向了历史，几百年前，有一个姓王的人，叫王阳明，这个人大家肯定都是知道的，他曾经说过一句话，破山中贼易，破心中贼难。我们每个人要论清世间的大道，首先就要破除这心中之贼。大总统曾经把这个叫做‘解放思想’，我是赞同的。孝悌忠信礼义谦，我也是赞同的。 但是中国文化，最大的贼，就是伪善，知行不合一，特别是官员，说一套做一套，这就是伪善!平常大家学习程朱理学，学到的无非是存天理，灭人欲。可是翻翻我们的历史，历朝历代，靠圣人之学，仁义道德当真就能够治国平天下了满口仁义道德是无法挽救一个国家的危亡的，你们想想，当官的所学四书五经、苦苦研习的八股文，能够抵抗洋人的坚船利炮吗能够改变贪腐横行，土地兼并，流民千里，国家积弊丛生的局面吗重名节而轻实务，这里面隐藏着的其实就是虚伪和虚弱。”
宋骁飞听后，带头给鲁迅鼓掌，礼堂里顿时响起了雷鸣般的掌声。鲁迅望了宋骁飞一眼，他的眼神充满了鼓励和支持，便大胆继续说：“道德改变不了一个人的命运，也根本不了一个国家的命运，空谈道德仁义，就是世间最大的伪善。所以，我们要依法治国，而这不是以德治国。中国传统知识分子的政治思维，无非是期待出个圣君，或者圣人，告诉人们天道，然后他站在拜相台上，挥一挥衣袖，四海升平，人民尊礼守法。孔子是这么想的，王莽是这么想的，李白也是这么想的。但翻开历史，上下五千年，中国道德的卫道士辈出，贞节牌坊立了不少，天下长治久安了吗？所以我们今天北京大学新成立的学院，叫崇实学院，就是要我们崇实去浮。”
礼堂有学生开始较好，点头称赞。鲁迅继续说：“中国文化第二个贼，就是守旧。我们喜欢说，从来如此，就要怎么样。不管什么事，从来如此，好像就是理所当然。孔子就把周朝的礼制当成宝贝。中国士大夫沉浸于章句小楷之积习，武夫悍卒又多粗蠢而不加细心，以致所用非所学，所学非所用。无事则嗤外国之利器为奇技术巧，以为不必学;有事则惊外国之利器为变怪神奇，以为不能学。但是，大家想过没有，从来如此，便对么 世间没有一成不变的道理，天下事穷则变，变则通。今日的世势，乃是三千年未有之大变局，因循守旧，固步自封，只会让我们这个国家越来越落后，越来越衰弱。长此以往，国将不国。”
整个礼堂内鸦雀无声，最初的窃窃私语都没有了，只有一片凝重的让人窒息的沉默。鲁迅继续说，“中国文化的第三个贼，就是糊涂，不讲逻辑。这一点突出表现在一些俚语中。可以举太多的例子。比如俗话说：宰相肚里能撑船；可俗话又说：有仇不报非君子！俗话说：男子汉大丈夫，宁死不屈；可俗话又说：男子汉大丈夫，能屈能伸！俗话说：人不犯我，我不犯人；可俗话又说：先下手为强，后下手遭殃！俗话说：一个好汉三个帮；可俗话又说：靠人不如靠己！俗话说：瘦死的骆驼比马大；可俗话又说：拔了毛的凤凰不如鸡！俗话说：宁为玉碎，不为瓦全；可俗话又说：留得青山在，不怕没柴烧！俗话说：浪子回头金不换；可俗话又说：狗改不了吃屎！俗话说：苦海无边，回头是岸；可俗话又说：开弓没有回头箭！俗话说：退一步海阔天空；可俗话又说：狭路相逢勇者胜！俗话说：后生可畏；可俗话又说：嘴上无毛，办事不牢！俗话说：得饶人处且饶人；可俗话又说：纵虎归山，后患无穷！俗话说：善有善报，恶有恶报；可俗话又说：人善被人欺，马善被人骑！俗话说：人人为我，我为人人；可俗话又说：人不为己，天诛地灭！俗话说：百事孝为先；可俗话又说：忠孝不能两全！俗话说：明人不做暗事；可俗话又说：兵不厌诈。如此总总，让人无所适从。于是就有高人站出来，说‘难得糊涂’。总之，中国文化总的来说是颠三倒四的，什么事都耍小聪明，喜欢和稀泥。这是全民族的失败，我们必须有新的文化，真正把中国人的心灵提高到理性水准，这样才能跟世界对话，不至于愚蠢到再拿义和团刀枪不入的神功去抵挡洋枪洋炮。我们必须通过坦率分析，去除中国人思维颠三倒四的非理性因素。”
说到最后，鲁迅总结说：“伪善、守旧、糊涂，就是中国文化的三大贼，希望在座诸君，崇实去浮，能够破除心中之贼，以中国的强盛为己任，不骄狂，不自卑，正视现实，为民族复兴发愤图强。”
宋骁飞听了，第一个站起来为鲁迅的精彩演讲鼓掌。那些怀疑鲁迅那么年轻就当教育部副部长的人，也闭上了嘴巴，北京大学的礼堂响起雷鸣般的掌声！(未完待续。。)