1906年底到1907年初的这几个月里，赵东云回到关外奉天后就是把主要精力都放在了内部区整顿上，军事上把三师五旅齐装满员，并利用有限的兵力布防东三省，整编巡警部队编成了十二个巡警团近两万人，同时还对东三省境内的大量土匪进行剿杀，为部队增加实战经验的同时也是肃清地方匪患。
政务上，他组建了东三省巡阅使府，裁并了大量行政机构的同时，也顺应时局建立了一批新式行政机构，从而奠定了东三省的现代化军政行政机构，以东三省巡阅使府为首，东三省陆军司令部和政务院并立，再有秘书处充当中枢、督察处充当司法监察，形成了由军方、文官、中枢、司法共同组成的行政体系。
经济上，赵东云组建奉天银行，推出奉天银元以及奉天纸币的同时，也是大力扶持民间金融业，推动传统的票号、钱庄进行现代化银行改革。
而在工商上，除了继续发展葫芦岛工业区外，他还筹办了营口工业区，喊出了打造‘世界级大豆产业基地’的口号，以东北的大量土豆为基础，深入发展大豆加工业，并且把大豆的两个主要加工产品：豆粉、豆油出口到日`本、欧洲，为东三省换取极为宝贵的外汇收入。
除了深入发展大豆产业外，~长~风~文~学~~cfwx~赵东云自然也不会说放弃或者轻视其他产业，比如说纺织业，这个产业过去两年来一直都是东三省重点扶持的产业项目，工商局那边已经是制定了两大目标，一个是重点发展安东地区的生丝产业，安东地区的生丝产业虽然不如南方浙江、江苏这些地区的规模，但是在北方地区也算是勉强过得去了，而且生丝是中国当代少数几种能够大量出口创汇的产品，所以甭管规模大小，先发展了再说，能捞多少外汇就捞多少外汇。
第二个就是重点发展以葫芦岛工业区为核心的棉花纺织业，包括纺纱、织布、染布等一系列的棉花纺织产品，不过棉花产业压力比较大，它们不但要和日`本、英国等洋布竞争外，也要和南方南通土布为代表的南方国产纺织业竞争。
大豆、纺织这两大产业就是赵东云拟定的现今以及未来的东三省主要支柱性产业了，除了这两大产业外，还有造纸、面粉、酿酒、矿业、机械、化工等产业，不过这些规模都不大，暂时而言还无法成为东三省的经济支柱。
如今的东三省还不是后世的重工业基地，而是一个非常典型的农业经济地区，其最主要的产品实际上并不是钢铁和煤炭，而是小麦和大豆，而工业的发展实际上也是主要依靠这两种农产品。
赵东云倒不是不想弄出来几个超大型的钢铁厂，搞什么重工业，但问题是他没钱投资啊，退一步时候就算有钱投资，这练出来的钢铁他卖给谁去啊？
任何工业生产都是必须有市场支撑的，不可能说赵东云张张嘴，挥挥手建起来一大批的工厂，然后这些工厂就能够生产出产品给他制造税收了，这些工厂生产出来的产品还得有市场呢。
就拿人们最熟悉的布匹来说，这生产出来的布匹不是说卖就能卖出去的，你还得和洋布、国产其他商家的布匹进行竞争呢。
再说钢铁，这年头国内的钢铁消费主要集中在两方面，一个是铁路，一个是军工，至于其他的民间钢铁消费几乎可以忽略不计，军工方面用不了多少，福元机器厂的附属钢铁厂，也就是唐山钢铁厂完全能够满足福元机器厂的钢铁消耗，之所以说福元机器厂还需要进口不少的钢铁材料，那是因为需要进口的这些材料都是高品质的合金钢，比如炮管用料，国内包括唐山钢铁厂在内都无法炼制这些炮管用钢。
而铁路所需的铁轨方面，目前国内修建的铁路并不多，南方的京汉铁路以及粤汉铁路这些铁路的铁轨都是被汉阳钢铁厂包揽了去，而北方的京张铁路以及东三省的两条直线铁路则是唐山钢铁厂占去了。
民间用铁上，东北方面情况还算比较好的，赵东云大力开发的葫芦岛共和区和营口工业区都是需要不少的钢铁用量，不过这些用量唐山钢铁厂就已经能够满足。
唐山钢铁厂，也就是福元机器厂的附属钢铁厂，投资规模可不小，历尽数年投资，福元机器厂以及累计投资三百多万两银子，产能目前虽然还不如汉阳钢铁厂，但是也算是中国第二大钢铁厂了。
该厂虽然是作为福元机器厂的附属钢铁厂筹建，但是其钢铁产量太大，福元机器厂只能消化一部分，大部分还是被京张铁路、东三省的几条铁路所需的钢轨所消化，说实话如果没有京张铁路和如今正在进行标准轨改造的安奉铁路这两大市场支撑着，这唐山机器厂就会陷入刚建成就停产的尴尬局面。
所以在市场不大，同时已经有了一个唐山钢铁厂的情况下，赵东云总不能再投几百万两银子建一个钢铁厂和唐山钢铁厂相互竞争不是，所以目前来说钢铁产业并不是赵东云的优先发展产业。
当然了，不优先发展钢铁，不代表赵东云不发展其他重工业了，比如煤炭业他就很支持，为啥？因为这煤炭挖出来有市场啊，如今国内外的工业可以说是蒸汽工业，火车运行需要煤炭，工厂运行需要煤炭，船只运行同样需要煤炭，这国内的煤炭市场一直都是在持续扩大，哪怕是唐山那边已经有了几个大型煤炭厂，但是赵东云依旧决定在奉天大规模开发煤炭，准备用来供应葫芦岛工业区以及未来的营口工业区。
其重点开发的就是抚顺，日俄战争期间抚顺由于生产大量煤炭，其煤炭被广泛用于俄军之中，而俄军也是在抚顺驻扎了相当多的部队，由于辽阳前线日军一直没能取得突破，所以这抚顺也就一直处于俄军的掌控之下。日俄战争结束后，俄军撤离，抚顺各矿山恢复正常运营，而赵东云也是在抚顺设立了‘抚顺矿务局’，全面管理该地区的煤矿生产。
并引进了北洋滦州矿务公司，也就是历史上大名鼎鼎的开滦煤矿的两个前身之一，不过该公司和历史已经不一样，历史上该公司是官办的，但是由于福元公司的加入，该公司成为了商办企业，只是和很多商办企业一样，有着一条‘洋人不得直接或者间接参股’的条款而已。这家矿务公司主要由周学熙主办的天津官银号、福元公司合股投资创办。
除了引进了滦州矿务公司在抚顺设立分厂外，赵东云还指示工商部下属的矿务处出资和福元公司以及另外几家商人一起合股成立了抚顺煤矿，并直接吞并收购了抚顺原有的几家小煤矿公司，比如王承晓主办的华兴利公司。
甚至为了开发抚顺的煤炭，奉天铁路公司还投资建设了奉天到抚顺的支线铁路。
赵东云如果说对煤炭产业只是有限度支持的话，那么对于军工产业那么就完全算得上全力支持了。
由于赵东云和当年的袁世凯一样，是想要办兵工厂但是手里没钱，想要办一个和福元机器厂同等规模的兵工厂，单单是用于购买设备的硬件投入就得至少三五百万两银子，而东三省财政局现在连扩军所需的四百万军费都拿不出来，那里有钱搞什么兵工厂啊，所以还得是走商办的老路子。
当年福元机器厂要是不搞商办，引入大量北方资本一起搞的话，这个资产已经超过千万两银子的兵工厂单凭北洋或者赵东云自身是无论如何也搞不起来的。
所以他用行政手段来迫使福元机器厂抽调资金，人员到沈阳设立分厂，，不过这设立分厂投资动辄数百万以上，福元机器厂一时间拿不出来那么多现金，赵东云又让那个奉天银行给他们提供贷款支持，又牵桥搭线寻找有实力的商家一起合股。
最后形成福元机器厂占股六成，其他各商家占股四成的投资比例。
这费了不少劲才把沈阳兵工厂给搭起架子来，目前已经进入搭建厂房，安装少量设备的阶段，而更多的设备已经在英国、德国甚至美国下了订单，未来数月内就能运抵国内进行安装调试，预计明年年初就能够小规模试生产，至于达成设计产量，那是后年以后的事了。
除了这个筹办中的沈阳兵工厂外，赵东云在军队内部还设立了三个修械所，分别是哈尔滨修械所，锦州修械所、沈阳修械所。这三个修械所是接受了前清以前在东北地区的一些官办兵工厂以及其他企业的部分老旧设备和人员，技术和规模自然不可能有多大，但是修理修理枪械还是问题不大的，总不能步枪坏了就拿到福元机器厂去修不是。
而当赵东云在东北发展工商，扩编军队的时候，段祺瑞、王士珍的部队如今却在两江、湖广地区和南方联邦打着呢。